來源：健康不是鬧著玩/作者：菠蘿
簡介：菠蘿，清華大學生物系本科，美國杜克大學癌癥生物學博士，現(xiàn)在美國加州從事癌癥新藥開發(fā)，著有科普書籍《癌癥.真相》。
如果你花錢請大仙算了一卦，但完事兒后，他不給你好好解卦，卻直接丟給你一本根本看不懂的“解卦大百科全書”，你想不想罵人？
現(xiàn)在的基因測序服務經(jīng)常就是這樣。
基因測序，一個火得不行的詞，不管是癌癥病人，孕產婦，還是普通老百姓，都或多或少會接觸到這個詞。國內各種基因測序公司如同雨后春筍一般，刺溜一下就冒出來了。
基因測序本身是個非常好的東西，正在迅速改變大家的生活，我舉雙手雙腳贊成靠譜測序的的應用推廣，尤其是在癌癥（比如遺傳基因檢測），優(yōu)生優(yōu)育（比如測罕見遺傳?。?，和微生物學（比如感染診斷）。
癌癥是基因測序的第一大市場。現(xiàn)在對很多癌癥病人，尤其是乳腺癌、肺癌、直腸癌病人，基因檢測幾乎是必做的。
但無論什么應用，基因測序有個最大的問題：普通老百姓看不懂結果，必須請專業(yè)人士咨詢指導。
但目前多數(shù)公司“管測不管說”，“管殺不管埋”，測序結果出來后直接丟一堆分析表格給顧客。很多客人看到結果后，開始惡補生物醫(yī)學知識，最后仍是一知半解。
有人向我感慨：“菠蘿，我真后悔當年高中生物課沒好好上。”為了讓大家感覺好一點，菠蘿可以放心的說，即使你當年高中生物課好好上了，你還是看不懂。
要正確理解基因測序結果，必須要有長期的生物學，尤其是遺傳學的訓練。在免費咨詢了幾十份基因測序結果以后，我發(fā)現(xiàn)，這也許是解決廣大生物同學就業(yè)難題的好機會！
“21世紀是生物的世紀”，這句話把一群人忽悠進生物專業(yè)已經(jīng)20年了，而這群人在寂寞中隱忍不言，就是在等大家看不懂基因測序結果的那一天。
基因測序結果長哪樣？癌癥病人基因測序結果到底有多復雜？ 下面是一份我咨詢過的肺癌基因測序報告的第1頁（一共35頁）：
能讀懂的請舉手！
有多少人拿到這個報告，放眼只看到了“肺癌”“基因”“藥物”這幾個詞？
全外顯子是啥？NCCN是啥？雜合多態(tài)性和純合多態(tài)性是啥？ADH1B基因是啥？R337C突變是啥？非移碼插入突變是啥？基因擴增1.8倍是啥？豐度是啥？
一句話，我的家人到底應該怎么治？
別說普通大眾，很多醫(yī)生或生物專業(yè)的人都不能完全搞懂這些玩意兒。
有人也許能一眼看到“EGFR基因，DdelinsDG第20外顯子非移碼插入突變（豐度44%）”是最關鍵的，其它很多信息對確定治療方案并沒有什么卵用。但這需要很多年的專業(yè)訓練。
對于大眾，這樣一份35頁的報告，如果沒人解讀，對于大眾無異于天書。
有人可能會說，基因檢測結果的讀者其實應該是醫(yī)生，而不是病人或家屬，稍微復雜一點無所謂。但如果我花了1萬多塊錢，我還是希望能懂一些東西，不是么？何況，萬一醫(yī)生也搞不懂呢?
基因測序結果怎么讀？現(xiàn)在很多公司推廣基因測序來進行癌癥風險評估，或者篩查。下面是一位mm花6千元買來的“女性癌癥風險評估套餐”結果。
該套餐測了20個和乳腺癌、卵巢癌相關的基因，結果測出了p53這個著名癌癥相關基因突變，具體是p.Pro72Arg：說明這個基因第72位的氨基酸由脯氨酸（Pro）變成了精氨酸（Arg）。
p53可是和癌癥相關最重要基因之一。這下把mm嚇壞了。
這突變是啥意思？mm心想先看看結果解釋吧。不看不要緊，看完更暈，第3條說：“Pro72Arg與乳腺癌風險具有顯著相關性”，第4條說：“Pro72Arg與乳腺癌患病風險無關”。
這不是自相矛盾么？有風險還是沒風險？
mm打電話去給客服，客服說：“抱歉，我也看不懂。”
菠蘿拿到后，一時也不確定，去做了好一會兒功課。最后解讀了三點（前方高能預警：此處開始有大量專業(yè)詞匯，只是為了嚴謹，讀者可以跳過，直達下一部分）：
1：Pro72Arg根本就不算是突變，而是自然發(fā)生的“基因單核苷酸多態(tài)性（SNP）”。這個多態(tài)性，簡單來說，就是指正常人群之中，有些人p53基因第72位是脯氨酸，有些人是精氨酸，但重要的是，無論哪種，都是正常蛋白，不是突變蛋白！這就像有些人是A血型，有些是B血型，雖然不同，但都是健康的。
2：報告里面的第3條和第4條顯然是互相矛盾的，這說明研究論文里對Pro72Arg到底是否增加癌癥風險沒有定論。
基因相關研究中這類矛盾的結果非常多！那怎么判斷哪邊觀點比較靠譜？
最安全的辦法當然是去讀那些論文。但如果讀不懂呢？那就看文章發(fā)表時間！比如這里，說Pro72Arg增加癌癥風險的文章大多發(fā)表在2005年之前，而說它沒有增加風險的文章則是最近10年的[1]。
請注意，一般來說，如果新舊研究論文水平類似，而且結論相反的話，菠蘿會選擇相信新文章！
原因有二，首先科學是不斷進步的，新的知識和技術往往讓研究更全面、完善、準確；另外新文章在發(fā)表之前，要經(jīng)過專家審稿。如果新文章結論和以往的相反，作者必須提供大量證據(jù)來說服專業(yè)審稿人。新文章得以發(fā)表，說明專業(yè)人士認可新的研究結論，而舊的結論不準確。
3：即使相信Pro72Arg增加癌癥風險，這位mm也是很安全的，因為她是雜合子，而不是純合子。生物學上，人是二倍體，每一種基因都有兩份，一份來自爸爸，一份來自媽媽。 p53基因也是一樣，如果兩個p53基因第72位都是都是脯氨酸，那就是脯氨酸純合子，如果都是精氨酸，則是精氨酸純合子。而這位mm是雜合子，說明她的爸媽給了倆不同的p53。提出Pro72Arg增加乳腺癌風險的舊文章，說的是精氨酸純合子的患癌風險，比雜合子或脯氨酸純合子略高[2]。沒有任何文章說雜合子會增加癌癥風險。
綜合上面三點，我告訴這位mm：“放心，沒事。”
基因測序公司的咨詢師應該做的事情，我代勞了。
靠譜的基因測序咨詢師在哪里？既然測序結果的解讀如此重要，基因測序公司為什么不多雇一些專業(yè)人士做咨詢師呢？
我能想到的有倆原因：第一，顧客群沒有強烈要求，沒必要去自我折騰，增加成本；第二，找不到合適的人；其中后者可能是主要原因：
1、中國目前沒有基因咨詢師這個專業(yè)，也沒地方考證，公司不知道應該找什么樣的人。
2、基因咨詢基本就是接電話，感覺和淘寶客服很像，不符合科學家追求自由和清高的天性。
3、國內基因測序公司還在群雄混戰(zhàn)階段，大家都在專心做市場，做后臺基因咨詢不受重視，收入也不高，有這功夫，還不如去開Uber呢。
因此，基因測序后的咨詢，現(xiàn)在是市場上很大的空白，但我認為同時也是很好的機會。首先做好咨詢客服的測序公司很可能積攢良好口碑，占領先機，成為測序界的“海底撈”。同時，不做測序，而專注做專業(yè)基因咨詢，也許有機會占領后期市場，并衍生出新產品，甚至垂直逆向整合。
21世紀什么最貴？人才！尤其是能解讀基因奧秘的人才。
所以，請珍惜你身邊每一位學生物的同學吧！各位看官請記得分享這篇文章，讓更多人了解基因測序的小小奧秘。
